Hvorfor blander du Hamburg-Berlin ind i det? Den strækning er 100% noget andet end Hamburg-Puttgarden og er dobbeltsporet, så den har ingen krydsningsstationer overhovedet -- heller ikke at optimere.

For det første ligger Femern øst for Hamburg, så Hamburg er en omvej for godstog mod øst og sydøst.
For det andet er der åbenbart en krydsningsstation ved navn Büchen mellem Lücbeck og Berlin:

Alle godstogene via Fehmarn kommer, uanset hvor de skal hen, til at køre via Hamburg, med mindre de skifter til diesel undervejs.

I så fald bliver Hamburg en flaskehals.